江苏省作物遗传生理国家重点实验室是由扬州大学江苏省作物栽培生理重点实验室（1993）、江苏省植物功能基因组学重点实验室（1993）、教育部植物功能基因组学重点建设实验室（2003）联合申请，于2004年获江苏省教育厅批准[苏科教（2004）13号]正式开始建设。该实验室培育点包含作物学博士后流动站、作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、农产品安全与环境、植物生物技术、植物学等5个二级学科博士点和作物学一级学科博士点，作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、植物生物技术、植物学、生态学、生物物理学等6个硕士点。